Los ecosistemas marinos son múltiples.
Van desde ecosistemas costeros, ese hombre logra con su acción modificar más porque los puntos de contacto son fácilmente accesibles, a ecosistemas oceánicos y abismales que, por el contrario, son poco antropizados y, por lo tanto, logran mantener entornos más equilibrados, porque los organismos que viven dentro de ellos solo siguen las leyes de la naturaleza, sin que el hombre pueda intervenir con su acción, a menudo destructiva.
Esta complejidad y variedad de ecosistemas marinos significa que el estudio del ciclo de vida y los comportamientos de los organismos que viven allí es mucho más difícil que en los ecosistemas terrestres. A menudo también es difícil catalogar todos los organismos, muchos de los cuales aún son desconocidos para el hombre.
Uno de los problemas más preocupantes es el hecho de que diferentes ecosistemas marinos están cambiando su equilibrio debido al cambio climático y los barcos que causan cada vez más inestabilidad, transportando especies de peces de un ecosistema a otro y causando alteraciones en la cadena alimentaria. Para dar un ejemplo, el ecosistema mediterráneo ha estado tropicizando durante algunos años: esto significa que muchas especies exóticas, que normalmente no pertenecen a un entorno como el de los mares mediterráneos, están alterando el equilibrio entre las especies nativas.
La pesca excesiva también causa desequilibrios, ya que provoca la despoblación de especies necesarias para la supervivencia de todo un ecosistema, alterando todos los niveles de la cadena alimentaria. Para bloquear este problema, muchas áreas son sometidas periódicamente a detención biológica, con la prohibición de pescar, para que el área pueda ser repoblada y no se creen más daños al ecosistema marino.
